Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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