Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMQ13315 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMQ13315 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMQ13315 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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