Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms