Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF5Q13243 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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