Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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CALCOCO2Q13137 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCOCO2Q13137 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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