Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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