Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
PRDM2Q13029 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PRDM2Q13029 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
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