Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFX1Q12986 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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NFX1Q12986 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFX1Q12986 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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