Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMSAP2Q08AD1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMSAP2Q08AD1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms