Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
DSC1Q08554 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC1Q08554 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC1Q08554 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC1Q08554 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC1Q08554 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC1Q08554 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC1Q08554 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC1Q08554 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC1Q08554 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC1Q08554 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC1Q08554 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms