Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL1Q08397 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms