Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN3Q08043 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms