Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK18Q07002 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms