Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms