Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms