Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLOD1Q02809 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms