Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
DSC2Q02487 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms