Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSG1Q02413 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DSG1Q02413 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DSG1Q02413 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DSG1Q02413 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms