Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms