Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLCB3Q01970 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms