Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC6A3Q01959 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms