Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MC1RQ01726 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MC1RQ01726 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms