Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK16Q00536 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms