Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD1P98174 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD1P98174 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD1P98174 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
FGD1P98174 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGD1P98174 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGD1P98174 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD1P98174 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms