Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN10P78369 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN10P78369 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms