Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-24P63145 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-24P63145 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms