Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TMEM258P61165 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms