Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB5BP61020 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms