Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP25P60880 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP25P60880 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms