Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERVFRD-1P60508 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms