Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBP2P56545 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms