Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLTPP55058 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLTPP55058 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLTPP55058 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PLTPP55058 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLTPP55058 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms