Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D1P54289 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA2D1P54289 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms