Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMTNP53814 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMTNP53814 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMTNP53814 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMTNP53814 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMTNP53814 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMTNP53814 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMTNP53814 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMTNP53814 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMTNP53814 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMTNP53814 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMTNP53814 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMTNP53814 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMTNP53814 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMTNP53814 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMTNP53814 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMTNP53814 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMTNP53814 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMTNP53814 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMTNP53814 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMTNP53814 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMTNP53814 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMTNP53814 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms