Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC3P51654 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC3P51654 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC3P51654 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC3P51654 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms