Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRCA2P51587 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms