Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASP4P49662 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASP4P49662 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP4P49662 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP4P49662 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP4P49662 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP4P49662 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP4P49662 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms