Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA1P49639 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms