Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA8P48165 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA8P48165 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA8P48165 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA8P48165 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA8P48165 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA8P48165 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA8P48165 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA8P48165 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA8P48165 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA8P48165 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA8P48165 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA8P48165 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA8P48165 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA8P48165 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA8P48165 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA8P48165 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA8P48165 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA8P48165 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA8P48165 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA8P48165 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA8P48165 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA8P48165 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA8P48165 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms