Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP2P46087 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP2P46087 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOP2P46087 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOP2P46087 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOP2P46087 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOP2P46087 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOP2P46087 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOP2P46087 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOP2P46087 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOP2P46087 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms