Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRATP43155 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRATP43155 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRATP43155 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRATP43155 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CRATP43155 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRATP43155 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms