Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MCAMP43121 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCAMP43121 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCAMP43121 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCAMP43121 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCAMP43121 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCAMP43121 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms