Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms