Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIA1P42261 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA1P42261 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms