Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK1P39086 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms