Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD13P35453 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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