Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJA4P35212 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJA4P35212 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJA4P35212 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJA4P35212 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms