Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms