Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKARP32238 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCKARP32238 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCKARP32238 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCKARP32238 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms