Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSPOP30536 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPOP30536 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPOP30536 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSPOP30536 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms